La stratégie d’application de la ville éponge est séparée en trois zones de la ville et diffère dans chacune d’elles. La première zone correspond au centre historique de la ville, où l’on trouve les bâtiments les plus anciens et ceux qui ont une certaine valeur. Dans cette zone, la stratégie peut s’interpréter par « Accepter et Accommoder », où l’on prévient les trop grandes entrées d’eau venant des zones des alentours. Les bâtiments historiques y sont protégés contre l’eau excessive. L’eau provenant des pluies et des inondations peut y être tolérée, si elle est gérée de manière sécuritaire et contrôlée.

La zone 2 est celle de la zone urbaine actuelle, qui est souvent en densification constante. La stratégie de cette zone se traduit par « Adapter et Moderniser », où l’on vient modifier le tissu existant dans le but de réduire les conséquences qu’apportent les inondations. On essaie d’instaurer des concepts qui s’orientent sur une régénération urbaine autonome en cas d’eau excessive. De plus, on vient y créer des espaces qui exploitent, nettoient et recyclent l’eau. L’application dans cette zone est très lente et prend plusieurs années à être complété.

La zone 3 est la zone des nouveaux développements, qui est souvent située en périphérie de la ville. Dans cette zone, la stratégie se définit par « Développer et Construire » des zones qui sont sensibles à l’eau et qui permettent de répondre à tous les objectifs de la ville éponge. Plusieurs composantes et technologies sont intégrées aux nouveaux développements dans le but d’y arriver, tel qui des toits verts, du stockage souterrain, des plaines inondables, des jardins pluviaux, etc. Cette étape peut être considérée comme la plus évidente à réaliser, puisqu’on construit à partir de terrains naturels, qui présentent peu de bâtis et peu de contraintes.